1) На разных. И ни одна из них не написана на чистом PHP.
2) Смотря что ты понимаешь под первоначальным умением. Умение программировать на PHP, кстати, мало коррелирует со знанием HTML. Тут гораздо важнее наличие опыта программирования вообще, на любых языках. Если опыта нет — будет непросто.
3) Стандартный набор технологий веб-программиста — это PHP, JavaScript (не путать с Java!), HTML и CSS. Flash сейчас все больше отходит с рынка. К тому времени, когда ты все это освоишь, уже будешь сам понимать, куда идти дальше.